На 25 јануари 1991 година, македонскиот парламент донесе Декларација за независност. На 8 септември Република Македонија слави 31 година од прогласувањето на независноста.
На 8 септември 1991 година, во поранешната југословенска република се одржа референдум, на кој повеќе од 95% од оние кои гласаа гласаа за создавање на посебна држава. Претходно, македонското Собрание на 25 јануари донесе Декларација за независност. Независноста беше формално прогласена на 18 септември 1991 година, кога парламентот усвои Декларација за независност врз основа на резултатите од референдумот.
Новиот Устав на Република Македонија беше донесен на 17 ноември истата година. Дел од албанската етничка заедница одби да учествува на референдумот и да го поддржи новиот устав на младата земја.
Десет години подоцна, Албанците ги поддржаа уставните измени кои беа постигнати по вооружениот конфликт пролетта 2001 година.
Бугарија беше првата земја што ја призна независноста на Македонија. Нејзиниот пример потоа го следеа Турција, Словенија, Хрватска, Русија и Босна и Херцеговина. Бугарскиот претседател Желио Желев (1990-1997) има огромни заслуги за признавањето на Македонија од Русија, Турција, САД и други земји на почетокот на овој процес.
На 8 април 1993 година, Генералното собрание на ОН ја прифати Македонија како 181 полноправна членка на Светската организација. Поради противењето на Грција, земјата беше прифатена како Поранешна Југословенска Република Македонија.
На 1 август 2017 година, премиерите на Бугарија и Македонија, Бојко Борисов и Зоран Заев, го потпишаа Договорот за пријателство и добрососедство, со што се отвори патот на земјата кон членство во НАТО и почеток на преговорите за членство во ЕУ. Речиси една година подоцна, Заев и Алексис Ципрас го потпишаа Договорот од Преспа, со кој заврши деценискиот спор за името. Следната година, Македонија официјално го промени своето име во Република Северна Македонија.